（2024年度より掲載．敬称略）
FY 2025
- 戦略的イノベーション創造プログラム (SIP) 第3期「統合型ヘルスケアシステムの構築」：テーマD-2「統合型の医学概念・知識連結データベースの構築及び医療文書の自動分析基盤の整備」（2023-2027, 研究開発責任者：荒牧 英治）
- JST CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新（バイオDX）」：「リアルワールドテキスト処理の深化によるデータ駆動型探薬」（2022-2027，研究代表者：荒牧 英治）
- 戦略的国際共同プログラム (SICORP) EIG CONCERT-Japan「カーボンニュートラルな都市の実現に向けたソリューション」：「スマート交通のための主体的ソーシャル基盤 (SO-SMART)」（2024-2026，研究代表者：若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(B)「患者が医療に貢献するための自然言語処理機構の開発」（2024-2026, 研究代表者：荒牧 英治，研究分担者：工藤 紀子）
- 科研費 基盤研究(B)「医療用語のエンティティリンキングに向けた実践的医療用語辞書の開発」（2023-2025, 研究代表者：河添 悦昌（東京大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(B)「術中の動画及び音声情報を用いた手術チームパフォーマンスの統合的解明」（2023-2025, 研究代表者：中島 和江（大阪大学），研究分担者：荒牧 英治・若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(B)「文章中の人物の移動軌跡を実世界の地図上に接地するための基礎研究とその応用」（2022-2025，研究代表者：大内 啓樹（NAIST），研究分担者：若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(C)「AIによる個別アドバイス機能を搭載したうつ病予防スマートフォン認知行動療法の開発」（2023-2025, 研究代表者：豊本 莉恵（京都大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(C)「ストラクチャーから整備されたがん診療連携拠点病院を長期的アウトカムから評価する」（2021-2025，研究代表者：宮代 勲（大阪国際がんセンター），研究分担者：若宮 翔子）
- 科研費 若手研究「温故知新：古典的推薦アルゴリズムと最先端LLMの融合」（2025-2027, 研究代表者：Shaowen Peng）
- 新医療リアルワールドデータ研究機構株式会社「医療テキストの構造化に関する研究」(2024-)
- 株式会社NTTドコモ「Slack等のIMSを用いた組織・チームの分析」(2023-2025)
- 株式会社ビジョンケア「遺伝子カウンセリングAI化に関する研究」(2023-)
- 花王株式会社「女性のQOL向上に対するエピソードバンクの有用性検証の研究」(2022-)
- 日本電気株式会社「電子カルテデータからの注釈付きコーパスの作成に関する研究」(2021-)
- LINEヤフー株式会社「学際領域におけるビッグデータとクラウドソーシング活用の研究」(2019-)
FY 2024
- 戦略的イノベーション創造プログラム (SIP) 第3期「統合型ヘルスケアシステムの構築」：テーマD-2「統合型の医学概念・知識連結データベースの構築及び医療文書の自動分析基盤の整備」（2023-2027, 研究開発責任者：荒牧 英治）
- 戦略的イノベーション創造プログラム (SIP) 第3期補正予算「統合型ヘルスケアシステムの構築における生成AIの活用」：「医療LLM基盤の研究開発・実装」（2024, 研究開発責任者：相澤 彰子（東京大学/NII），研究分担者：荒牧 英治）
- JST CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新（バイオDX）」：「リアルワールドテキスト処理の深化によるデータ駆動型探薬」（2022-2027，研究代表者：荒牧 英治）
- 戦略的国際共同プログラム (SICORP) EIG CONCERT-Japan「カーボンニュートラルな都市の実現に向けたソリューション」：「スマート交通のための主体的ソーシャル基盤 (SO-SMART)」（2024-2026，研究代表者：若宮 翔子）
- AMED 医薬品等規制調和・評価研究事業「緊急的な状況における薬事行政と市民の相互理解に寄与するコミュニケーション法の検討」（2023-2024，研究代表者：北村 温美（大阪大学），研究分担者：荒牧 英治）
- AMED 障害者対策総合研究開発事業「精神科トランスレーショナルリサーチの推進に向けた精神医学研究システムの開発」（2023-2024, 研究代表者：尾崎 紀夫（名古屋大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(B)「患者が医療に貢献するための自然言語処理機構の開発」（2024-2026, 研究代表者：荒牧 英治，研究分担者：工藤 紀子）
- 科研費 基盤研究(B)「医療用語のエンティティリンキングに向けた実践的医療用語辞書の開発」（2023-2025, 研究代表者：河添 悦昌（東京大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(B)「術中の動画及び音声情報を用いた手術チームパフォーマンスの統合的解明」（2023-2025, 研究代表者：中島 和江（大阪大学），研究分担者：荒牧 英治・若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(B)「文章中の人物の移動軌跡を実世界の地図上に接地するための基礎研究とその応用」（2022-2025，研究代表者：大内 啓樹（NAIST），研究分担者：若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(C)「Webビッグデータを用いたパンデミックにおける人々の思いの計量化と可視化」（2022-2024，研究代表者：若宮 翔子）
- 科研費 基盤研究(C)「AIによる個別アドバイス機能を搭載したうつ病予防スマートフォン認知行動療法の開発」（2023-2025, 研究代表者：豊本 莉恵（京都大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(C)「疫学を中心とした学際的アプローチに基づく医学論文査読の実証分析と教育への応用」（2022-2024，研究代表者：大前 憲史（福島県立医科大学），研究分担者：荒牧 英治）
- 科研費 基盤研究(C)「ストラクチャーから整備されたがん診療連携拠点病院を長期的アウトカムから評価する」（2021-2025，研究代表者：宮代 勲（大阪国際がんセンター），研究分担者：若宮 翔子）
- 科研費 特別研究員奨励費「「名誉毀損」法解釈を基準としたオンライン上の問題のある言論の検出」（2023-03-08 – 2025-03-31，研究代表者：久田 祥平）
- 2024年度AIPチャレンジ（CREST バイオDX）「自然言語処理の応用による精度の高い治療効果推定の実現」（2024，研究代表者：清水 聖司）
- 新医療リアルワールドデータ研究機構株式会社「医療テキストの構造化に関する研究」(2024-)
- 株式会社NTTドコモ「Slack等のIMSを用いた組織・チームの分析」(2023-2025)
- 株式会社ビジョンケア「遺伝子カウンセリングAI化に関する研究」(2023-)
- 花王株式会社「女性のQOL向上に対するエピソードバンクの有用性検証の研究」(2022-)
- 日本電気株式会社「電子カルテデータからの注釈付きコーパスの作成に関する研究」(2021-)
- LINEヤフー株式会社「学際領域におけるビッグデータとクラウドソーシング活用の研究」(2019-)