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業績

FY 2025

国際会議

  1. Masami Tsuchiya, Kiminori Shimamoto, Yoshimasa Kawazoe, Emiko Shinohara, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Shungo Imai, Hayato Kizaki, Satoko Hori, and Eiji Aramaki: Natural Language Processing-Based Approach to Detect Common Adverse Events of Anticancer Agents from Unstructured Clinical Notes: A Time-to-Event Analysis, MEDINFO2025 (Oral) (2025/8/13, Taipei, Taiwan) (to appear)
  2. Takeshi Ito, Tomohide Yoshie, Sohei Yoshimura, Nobuyuki Ohara, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, and Eiji Aramaki: Large Language Models can be a good medical annotator: A case study of drug change detection in Japanese EHRs, MEDINFO2025 (Oral) (2025/8/13, Taipei, Taiwan) (to appear)
  3. Tomohiro Nishiyama, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Satoko Hori, and Eiji Aramaki: Monitoring Over-The-Counter Drug Use from Japanese User-Generated Data, MEDINFO2025 (Oral) (2025/8/13, Taipei, Taiwan) (to appear)
  4. Yuka Otsuki, Shuntaro Yada, Tomohiro Nishiyama, Toshiyuki Sakurai, Masafumi Okada, Noriko Kudo, Kyoko Kawabata, Takako Fujimaki, Hiroyuki Nagai, Shoko Wakamiya, and Eiji Aramaki: Efficient Maintenance of Large-Scale Medical Dictionaries Using Large Language Models: A Case for Biomarkers, MEDINFO2025 (Oral) (2025/8/12, Taipei, Taiwan) (to appear)
  5. Jude Crener Junior Pierre, Gabriel Herman Bernardim Andrade, Shaowen Peng, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, and Eiji Aramaki: Abbreviation Expansion using only a Single Word as Context, MEDINFO2025 (Poster) (2025/8/12, Taipei, Taiwan) (to appear)
  6. Seiji Shimizu, Ibrahim Baroud, Lisa Raithel, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, and Eiji Aramaki: RecordTwin: Towards Creating Safe Synthetic Clinical Corpora, In Findings of the Association for Computational Linguistics: ACL 2025 (Poster) (2025/7/29, Vienna, Austria) (to appear)
  7. Seiji Shimizu, Shohei Hisada, Yutaka Uno, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, and Eiji Aramaki: Exploring LLM Annotation for Adaptation of Clinical Information Extraction Models under Data-sharing Restrictions, In Findings of the Association for Computational Linguistics: ACL 2025 (Poster) (2025/7/29, Vienna, Austria) (to appear)

国内会議

  1. 伊藤 健，吉江 智秀，吉村 壮平，尾原 信行，矢田 竣太郎，若宮 翔子，荒牧 英治：大規模言語モデルによる日本語電子カルテの治療中止理由分類，2025年度 人工知能学会全国大会（第39回），4A1-GS-10-02（口頭）（2025/5/30, 大阪国際会議場）

FY 2024

学術論文誌

  1. Tatsuki Hasegawa, Hayato Kizaki, Shungo Imai, Yuki Yanagisawa, Shuntaro Yada, Eiji Aramaki, and Satoko Hori: Improving Systematic Review Updates with Natural Language Processing: A Study on Screening Model Efficiency Through Component Classification and Selection, JMIR Medical Informatics 2025;13:e65371 (2025/3/27) [OPEN ACCESS] (IF 3.1)
  2. Yuki Yanagisawa, Satoshi Watabe, Sakura Yokoyama, Kyoko Sayama, Hayato Kizaki, Masami Tsuchiya, Shungo Imai, Mitsuhiro Someya, Ryoo Taniguchi, Shuntaro Yada, Eiji Aramaki, and Satoko Hori: Identifying Adverse Events in Outpatients With Prostate Cancer Using Pharmaceutical Care Records in Community Pharmacies: Application of Named Entity Recognition, JMIR Cancer 2025;11:e69663 (2025/3/11) [OPEN ACCESS] (IF 3.3)
  3. Yoshimasa Kawazoe, Masami Tsuchiya, Kiminori Shimamoto, Tomohisa Seki, Emiko Shinohara, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Shungo Imai, Eiji Aramaki, and Satoko Hori: Natural language processing of electronic medical records identifies cardioprotective agents for anthracycline induced cardiotoxicity, Scientific Reports, 15:6678 (2025/2/24) [OPEN ACCESS] (IF 3.8)
  4. Takuya Fukushima, Masae Manabe, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Akiko Yoshida, Yusaku Urakawa, Akiko Maeda, Shigeyuki Kan, Masayo Takahashi, and Eiji Aramaki: Evaluating and Enhancing Japanese Large Language Models for Genetic Counseling Support: Comparative Study of Domain Adaptation and the Development of an Expert-Evaluated Dataset, JMIR Medical Informatics 2025;13:e65047 (2025/1/16) [OPEN ACCESS] (IF 3.1)
  5. Yoshimasa Kawazoe, Kiminori Shimamoto, Tomohisa Seki, Masami Tsuchiya, Emiko Shinohara, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Shungo Imai, Satoko Hori, and Eiji Aramaki: Post-marketing surveillance of anticancer drugs using natural language processing of electronic medical records, npj Digital Medicine, 7(315) (2024/11/9) [OPEN ACCESS] (IF 12.4)
  6. Shuntaro Yada, Tomohiro Nishiyama, Shoko Wakamiya, Yoshimasa Kawazoe, Shungo Imai, Satoko Hori, Eiji Aramaki: Utility analysis and demonstration of real-world clinical texts: A case study on Japanese cancer-related EHRs, PLoS ONE 19(9): e0310432 (2024/9/11) [OPEN ACCESS] (IF 3.1)
  7. Gabriel Herman Bernardim Andrad, Shuntaro Yada, Eiji Aramaki: Is Boundary Annotation Necessary? Evaluating Boundary-Free Approaches to Improve Clinical Named Entity Annotation Efficiency: Case Study, JMIR Medical Informatics, 12:e59680, 2024 (2024/7/2) [OPEN ACCESS] (IF 3.1)
  8. Zhouqing Zhang, Kongmeng Liew, Roeline Kuijer, Wan Jou She, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Eiji Aramaki: Differing Content and Language Based on Poster-Patient Relationships on the Chinese Social Media Platform Weibo: Text Classification, Sentiment Analysis, and Topic Modeling of Posts on Breast Cancer, JMIR Cancer, 10:e51332, 2024 (2024/5/9) [OPEN ACCESS] (IF 2.8)

国際会議

  1. Seiji Shimizu, Shuntaro Yada, Lisa Raithel, Eiji Aramaki: Improving Self-training with Prototypical Learning for Source-Free Domain Adaptation on Clinical Text, In Proceedings of the 23rd Workshop on Biomedical Language Processing (BioNLP), pp. 1-13 (2024/8/16, Bangkok, Thailand)
  2. Seiji Shimizu, Lis Pereira, Shuntaro Yada, Eiji Aramaki: QA-based Event Start-Points Ordering for Clinical Temporal Relation Annotation, In Proceedings of the 2024 Joint International Conference on Computational Linguistics, Language Resources and Evaluation (LREC-COLING 2024), pp. 13371-13381 (2024/5/24, Torino, Italy)

国内会議

  1. 大槻 優佳，矢田 竣太郎，西山 智弘，工藤 紀子，川端 京子，藤牧 貴子，永井 宥之，若宮 翔子，荒牧 英治：大規模言語モデルを活用した大規模医療用語辞書メンテナンスの効率化，言語処理学会第31回年次大会 (NLP2025)，B9-3（2025/3/13，出島メッセ長崎）
  2. 橋本清斗，清水聖司 ，工藤紀子，矢田竣太郎，若宮翔子，江本駿，西村由希子，荒牧英治：質的研究の自動化:患者自由記述テキストからの潜在的トピックの発見，言語処理学会第31回年次大会 (NLP2025)，P6-1（ポスター発表）（2025/3/12，出島メッセ長崎）
  3. 辻 航平，平岡 達也，Cheng Yuchang，荒牧 英治，岩倉 友哉：誤字に対するTransformerベースLLMのニューロンおよびヘッドの役割調査，言語処理学会第31回年次大会 (NLP2025)，P2-11（ポスター発表）（2025/3/11，出島メッセ長崎）
  4. 柳澤 友希，渡部 哲，横山 さくら，木崎 速人，今井 俊吾，染谷 光洋，谷口 亮央，矢田 竣太郎，荒牧 英治，堀 里子：自然言語処理技術を活用した薬局薬歴の症状聴取に基づくアセスメント内容の可視化，第34回日本医療薬学会年会，P0454-3-PM1（ポスター発表）（2024/11/3，幕張メッセ 国際展示場）
  5. 土屋 雅美，嶋本 公徳，河添 悦昌，篠原 恵美子，矢田 竣太郎，若宮 翔子，今井 俊吾，木崎 速人，堀 里子，荒牧 英治：自然言語処理を用いた診療テキストデータからのがん薬物療法副作用検出と可視化手法の提案，第34回日本医療薬学会年会，P0317-2-PM（ポスター発表）（2024/11/2，幕張メッセ 国際展示場）
  6. Yukiko Ohno, Tohru Aomori, Riri Kato, Yuma Hikita, Reina Fujiki, Haruki Ishikawa, Keisuke Kiyomiya, Minae Isawa, Mayumi Mochizuki, Tomohiro Nishiyama, Eiji Aramaki, Hisakazu Ohtani: Extraction of diseases and symptoms from patients’complaints using natural language processing system, 第34回日本医療薬学会年会，IO-04（2024/11/2，幕張メッセ 国際会議場）優秀演題賞
  7. 井上真理，土屋雅美，嶋本公徳，河添悦昌，篠原恵美子，矢田竣太郎，若宮翔子，今井俊吾，木崎速人，堀里子，荒牧英治：診療記録を活用したフッ化ピリミジン系抗がん薬誘発性口内炎に対するAT2受容体拮抗薬の予防効果の検証，第34回日本医療薬学会年会，2-7-O03*-5（2024/11/2，幕張メッセ 国際会議場）優秀演題賞
  8. 土屋雅美，河添悦昌，嶋本公徳，関倫久，今井俊吾，木﨑速人，篠原恵美子，矢田竣太郎，若宮翔子，荒牧英治，堀里子：診療記録に自然言語処理を用いたカペシタビン誘発性手足症候群に対するセレコキシブの予防効果の検証，第62回日本癌治療学会学術集会，O53-3（2024/10/25，マリンメッセ福岡）
  9. 清水 聖司，矢田 竣太郎，若宮 翔子，荒牧 英治：RECORD TWIN: 病歴を保ちつつ表現が異なる症例の生成，情報処理学会 第260回 自然言語処理研究発表会（2024/6/28，北陸先端科学技術大学院大学 (JAIST) 金沢駅前オフィス）優秀研究賞
  10. 福島 拓也，眞鍋 雅恵，矢田 竣太郎，若宮 翔子，荒牧 英治，吉田 晶子，浦川 優作，前田 亜希子，寒 重之，高橋 政代：JGCLLM: 日本語遺伝カウンセリング大規模言語モデル，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 3S5-OS-7c-01（2024/5/30，アクトシティ浜松）
  11. 眞鍋 雅恵，矢田 竣太郎，若宮 翔子，荒牧 英治：エピソードバンク：当事者のナラティブをデータベース化する試み，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 3S1-OS-7b-02（2024/5/30，アクトシティ浜松）
  12. 久村 颯海，佐山 杏子，渡部 哲，木﨑 速人，今井 俊吾，岸田 徹，福岡 奈津美，矢田 竣太郎，荒牧 英治，堀 里子：がん経験者インタビューテキストを用いたがん患者の感情分析，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 3S1-OS-7b-01（2024/5/30，アクトシティ浜松）
  13. 渡部 哲，西岡 愉史，柳澤 友希，佐山 杏子，木﨑 速人，今井 俊吾，染谷 光洋，谷口 亮央，矢田 竣太郎，荒牧 英治，堀 里子：深層学習を用いた患者主訴からの有害事象シグナル検出器の有用性評価，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 2S6-OS-7a-05（2024/5/29，アクトシティ浜松）
  14. 嶋本 公徳，河添 悦昌，篠原 恵美子，矢田 竣太郎，若宮 翔子，今井 俊吾，堀 里子，荒牧 英治：電子カルテ記録からの医薬品有害事象サーベイランス手法の開発，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 2S6-OS-7a-02（2024/5/29，アクトシティ浜松）
  15. 大槻 優佳，大塚 皇輝，矢田 竣太郎，若宮 翔子，荒牧 英治，尾原 信行，吉江 智秀：臨床研究 DX の試み：脳卒中リスク因子のテキスト構造化システム，2024年度 人工知能学会全国大会（第38回）, 2S6-OS-7a-01（2024/5/29，アクトシティ浜松）

受賞

  1. 2024, 第34回日本医療薬学会年会，優秀演題賞 2件
  2. 2024, 情報処理学会 第260回自然言語処理研究発表会，優秀研究賞

FY 2022

学術論文誌

  1. Suzuki S, Imai S, Mitsuboshi S, Kizaki H, Hashiguchi M, Hori S: Detection of vaccine adverse events before package insert revisions using a Japanese spontaneous reporting system, J Clin Pharmacol, 10.1002/jcph.2243, 2022. (2023/04/12) [OPEN ACCESS]
  2. Lean Franzl Lim Yao, Kiki Ferawati, Kongmeng Liew, Shoko Wakamiya, Eiji Aramaki: Disruptions in the Cystic Fibrosis Community’s Experiences and Concerns During the COVID-19 Pandemic: Topic Modeling and Time Series Analysis of Reddit Comments, Journal of Medical Internet Research, 25:e45249, 2022. (2023/04/20) [OPEN ACCESS]
  3. Chatani R, Kondo S, Kamimura T, Suzuki S, Komatsubara E, Hayashi S, Hashiguchi M, Kizaki H, Imai S, Hori S: Exploring factors affecting the occurrence of hypersensitivity reactions induced by nonionic iodine contrast media, J Clin Pharmacol, 10.1002/jcph.2256, 2022. (2023/04/28) [OPEN ACCESS]

国際会議

  1. Lean Franzl Lim Yao, Kongmeng Liew, Shoko Wakamiya, Eiji Aramaki: Extracting Spatio-Temporal Trends in Medical Research Prioritization Through Natural Language Processing of Case Report Abstracts, MedInfo 2023, 2022. (2022/07/10)
  2. Faith Wavinya Mutinda, Kongmeng Liew, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Eiji Aramaki: PICO Corpus: A Publicly Available Corpus to Support Automatic Data Extraction from Biomedical Literature, In Proceedings of the Workshop on Information Extraction from Scientific Publications (WIESP 2022), 2022. (2022/11/21)
  3. Nishioka S, Asano M, Yada S, Aramaki E, Yajima H, Kizaki H, Hori S: Detection of adverse event signals with severity grade classification from cancer patient narrative, MEDINFO2023, 2022. (2023/07/11) (accepted)

国内会議

  1. 河添 悦昌, 永島 里美, 大江 和彦：アレルギー情報の標準化を目指すJFAGYアレルゲン用語集とアレルゲン コードシステム，第42回医療情報連合大会, 2022.（2022/11/19）
  2. 柴田 大作, 河添 悦昌, 篠原 恵美子, 嶋本 公徳：患者状態表現の病名交換コードへのマッピング，第42回医療情報連合大会, 2022.（2022/11/20）
  3. 平林(宮部)真衣, 柴田 大作, 篠原 恵美子, 河添 悦昌：流言の訂正はCOVID-19ワクチン接種に影響を与えるか?，グループウェアとネットワーク サービスワークショップ 2022(GNWS2022) , 2022. (2022/11/25)
  4. 古賀 貴士，矢田 竣太郎 ，若宮 翔子，荒牧 英治：膨大な医学知識を用いたカルテ入力誤り文検出，第15回データ工学と情報マネジ メントに関するフォーラム (DEIM2023) , 2022.  (2023/03/06)
  5. Zhouqing Zhang, Kongmeng Liew, Wanjou She, Shuntaro Yada, Shoko Wakamiya, Eiji Aramaki：Text classification for breast cancer patient identity from Weibo posts，第15回データ工学と情報マネジ メントに関するフォーラム (DEIM2023) , 2022. (2023/03/06) 学生プレゼンテーション賞
  6. 西山 智弘，矢田 竣太郎 ，若宮 翔子，堀 里子，荒 牧 英治：ソーシャルメディアを用いた一般用医薬品のファーマコビジランス，言語処理学会 第29回年次大会 (NLP2023), pp.1755-1760, 2022. (2023/03/15)
  7. 清水 聖司，矢田 竣太郎 ，荒牧 英治：Variational Auto-Encoder による症例報告生成，言語処理学会 第29回年次大会 (NLP2023), pp.2731-2736, 2022. (2023/03/16)
  8. 沖本 綾音，木﨑 速人，飯 野 温，卯田 健太，今井 俊吾，田中 聡一，森 貴幸 ，堀 里子：薬局での症状モニタリングにおける患者症状聞き取りアプリケーションの有用性評価，日本薬学会第143年会, 2022. (2023/03/27)

受賞

  1. 2022, 第15回データ工学と情報マネジメントに関するフォーラム (DEIM2023) 学生プレゼンテーション賞
  2. 2022, 日本薬学会第143年会 学生優秀発表賞